MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 6827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013740	CAGCC	2	10	1712461	1712470	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5002	NC_013740	TGA	2	6	1712498	1712503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013740	GA	3	6	1712549	1712554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013740	CG	4	8	1712695	1712702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_013740	TCCG	2	8	1712706	1712713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_013740	CTCG	2	8	1712805	1712812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_013740	GGT	2	6	1712835	1712840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013740	ATTTCA	2	12	1712991	1713002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5009	NC_013740	GCC	2	6	1713105	1713110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_013740	CTT	2	6	1713157	1713162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_013740	TC	3	6	1713379	1713384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_013740	TACGG	2	10	1713405	1713414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5013	NC_013740	GCCTCA	2	12	1713492	1713503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_013740	GAC	2	6	1713680	1713685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_013740	CCA	2	6	1713769	1713774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_013740	GAC	2	6	1713793	1713798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013740	CTC	2	6	1713817	1713822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_013740	TGG	2	6	1713930	1713935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_013740	GTT	2	6	1713958	1713963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013740	TC	3	6	1714053	1714058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_013740	GCA	2	6	1714080	1714085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_013740	GAG	2	6	1714191	1714196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013740	TCC	2	6	1714278	1714283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_013740	TTC	2	6	1714436	1714441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_013740	AAG	2	6	1714563	1714568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013740	C	6	6	1714590	1714595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5027	NC_013740	CCT	2	6	1714642	1714647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013740	CT	3	6	1714757	1714762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_013740	TCGC	2	8	1714782	1714789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_013740	TCC	2	6	1714821	1714826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_013740	TTCCC	2	10	1714855	1714864	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5032	NC_013740	TGG	2	6	1714888	1714893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013740	TAG	2	6	1715008	1715013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_013740	TCG	2	6	1715058	1715063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_013740	CT	3	6	1715103	1715108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_013740	ATC	2	6	1715237	1715242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_013740	TTTGT	2	10	1715257	1715266	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_013740	CGA	2	6	1715344	1715349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_013740	AAGT	2	8	1715356	1715363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_013740	AGG	2	6	1715392	1715397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013740	ATC	2	6	1715448	1715453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_013740	GTG	2	6	1715519	1715524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013740	GT	3	6	1715534	1715539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013740	TTG	2	6	1715682	1715687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013740	GTA	2	6	1715697	1715702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013740	GT	3	6	1715704	1715709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013740	ATG	2	6	1715729	1715734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013740	TCC	2	6	1715755	1715760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_013740	CCA	2	6	1715791	1715796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_013740	CACGA	2	10	1715856	1715865	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5051	NC_013740	GAC	2	6	1715869	1715874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5053	NC_013740	GAA	2	6	1715904	1715909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5055	NC_013740	CCT	2	6	1716097	1716102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_013740	TCC	2	6	1716221	1716226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5059	NC_013740	TAT	2	6	1716467	1716472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013740	ACA	2	6	1716494	1716499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_013740	TCA	2	6	1716522	1716527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_013740	CTG	2	6	1716579	1716584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_013740	ATC	2	6	1716653	1716658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013740	CTA	2	6	1716682	1716687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_013740	TCT	2	6	1716708	1716713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_013740	CT	3	6	1716748	1716753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_013740	TGT	2	6	1716800	1716805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_013740	A	7	7	1719868	1719874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013740	AAT	2	6	1719876	1719881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_013740	GGA	2	6	1723837	1723842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_013740	TAA	2	6	1723847	1723852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013740	TGC	2	6	1725248	1725253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_013740	CTATT	2	10	1727336	1727345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_013740	TGA	2	6	1727349	1727354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_013740	T	7	7	1727435	1727441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_013740	TGTT	2	8	1727445	1727452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_013740	AG	3	6	1727491	1727496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013740	GCG	2	6	1728437	1728442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_013740	T	6	6	1728447	1728452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_013740	CA	3	6	1728536	1728541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_013740	AGC	2	6	1728635	1728640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5106	NC_013740	CTT	2	6	1732534	1732539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5108	NC_013740	CTGT	2	8	1732668	1732675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_013740	T	7	7	1732846	1732852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013740	GCT	2	6	1732868	1732873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5112	NC_013740	CAT	2	6	1732954	1732959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_013740	T	7	7	1734936	1734942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013740	CTTC	2	8	1735998	1736005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5120	NC_013740	TTGTA	2	10	1736704	1736713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_013740	ATT	3	9	1737730	1737738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013740	ATTTT	2	10	1737745	1737754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_013740	GTT	2	6	1737758	1737763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013740	TCAA	2	8	1737787	1737794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_013740	AGG	2	6	1737808	1737813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5130	NC_013740	GAA	2	6	1740971	1740976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5260	NC_013740	TTTAT	2	10	1796897	1796906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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